档案系统是作业系统的一部分，它使得磁碟、CDs 及 DVDs 之类的实体储存媒体和其他可携式记忆装置看起来像资料夹与档案层级结构形式。档案系统是逻辑组织与实作有所区别的一个好例子：档案系统组织及储存资讯于 许多不同种类的设备上，但作业系统为这些设备全部呈现相同的介面。档案系统储存资讯的方式可能有实务及法律的含义，因此，学习档案系统的另一个理由是要了解何以「移除一个档案」并不意味着此档案的内容就此永久消除了。

档案系统管理所有资讯，方便应用程式及作业系统的其余部分读取和写入。它协调存取作业，确保有效率地执行，不会彼此干扰；它记录资料的实际位置，确保各项资料区分开来，以免部分电子邮件莫名其妙地跑到试算表或纳税申报中。在支援多个使用者的档案系统中，它实行资讯隐私于安全，不能让一个使用者在无权限下存取另一个使用者的档案，它也可能对每个使用者能用的空间量实施配额制。

在最低层级，可以透过系统呼叫请求档案系统服务，通常是由软体函式库增补，以使一般的运算易于编程。